Το 2003 ανακοινώνεται από τον τότε Υπουργό Παιδείας ότι έχει απαλλοτριωθεί οικόπεδο μεταξύ των οδών Χαριλάου Τρικούπη και Μαυρομιχάλη για τη στέγαση του 46ου Γυμνασίου και Λυκείου Νεάπολης στην Αθήνα. Και παρά το γεγονός ότι τον ίδιο χρόνο το Δημοτικό Συμβούλιο της Αθήνας δίνει το πράσινο φως στον Οργανισμό Σχολικών Κτιρίων, ώστε να ξεκινήσουν οι διαδικασίες ανέγερσης του σχολείου στο οικόπεδο που βρίσκεται στο οικοδομικό τετράγωνο Μαυρομιχάλη - Ξιφίου - Χαριλάου Τρικούπη και Διγενή Ακρίτα, το Γυμνάσιο και Λύκειο Νεάπολης εξακολουθούν να συστεγάζονται στο ίδιο αρχικό και ανεπαρκές για τις ανάγκες τους κτίριο.
Οι κάτοικοι της περιοχής καταγγέλλουν ότι παρά τη χαρακτηριστική πινακίδα «Οργανισμός Σχολικών Κτιρίων - Χώρος για ανέγερση Σχολείου» και τη σχετική περίφραξη, εισήλθαν στο οικόπεδο συνεργεία και καθάρισαν το χώρο. Τοποθέτησαν δε χειρόγραφες πινακίδες με την ένδειξη «Απαγορεύεται το πάρκινγκ - Ο χώρος ανήκει στο Υπουργείο Υποδομών».